（株）プロジェクトレンズのヤマトは実弟であるタカシの救助を求める。
語られるのは、ジンがかつて彼らに及んだ凶行の全貌。
そしてメインクエストを進めるなかで、
ハガ達は長い年月を経て変わり果てたかつてのデバッガーに出くわすことになる。