男子高校生・山田陸（やまだりく）は、何の変哲もない日常を送っていた。だがある日、突如現れた怪物に襲われ、平凡な生活は一変する。逃げ場を失った陸の耳に「このペンダントを握って」という謎の声が響き、反射的にそれを掴んだ瞬間、眩い光に包まれた。そして、目を開けた陸の姿は…美少女！？ 　突然の変身に驚く間もなく、迫りくる怪物との戦闘が始まる。拳を振り下ろすと、信じられない力が発動し、怪物を一撃で粉砕。だが、ホッとする間もなく鏡に映る自分の姿を見て陸は絶句する。「これ、俺…なのか？」 　戸惑いながらも、自らの力の謎を探る陸は、同じく魔法少女として戦う仲間たちと出会う。彼らとの絆や衝突を通じて、魔法少女に選ばれた「少女しかなれない」という厳然たる事実と、街に現れる怪物たちの真の目的を少しずつ知っていく。 　「男だけど魔法少女」――誰にも言えない秘密を抱えながら、陸は少女の姿で迫る脅威に立ち向かう。友情、葛藤、そして戦いの日々。果たして彼は、"普通の男子高校生"に戻れるのか？それとも、この姿のまま未来を切り拓いていくのか？波乱に満ちた魔法少女（物理）生活が、いま幕を開ける！