平凡な見た目で地味な山田大和（やまだやまと）は、少し前に留学してきたソフィア・アレンシーナに生き別れになった兄に付いて知らないか聞かれる。 詳しく話を聞いてみると、彼女はその兄のコードネームである『ダークネスシャドウ』しか知らないと言う。しかし、それは山田大和のコードネームだった。 不安を感じた彼はソフィアに協力することを申し出るが……。