異なる世界がゲートを通じて繋がった「真の２０００年問題」から２５年。異世界からの留学生を受け入れている白楼高校では新入生五人によって休止状態であった漫画研究部が再起する。 　ついに真の２０００年問題を引き起こした存在、双狛が復活する。狙いは響とリーザ？　世界を喰らう獣との決戦が始まる最中、響は新たな姿に覚醒する。 　真の２０００年問題ビギニング編、開幕！