とある世界線。３度の大戦を乗り越えた文明社会はようやく平穏を取り戻そうとしていた。だがそこに謎の黒影という人外の勢力の猛攻撃を受ける。数の暴力で押し寄せる黒影たちの前に人類は徐々に押され、一部の国や都市は実質滅んでしまった。 そんな荒廃した世界の中、とある二人の少女が廃ビルの谷間を駆け巡っていた。哀れな過去を背負った二人はともに戦い、共に生きる。そんな中二人はとある組織に接触する。 二人はそこから広い世界を見る。