原子一個まで再現していかなるメカでも構築できるという究極のメカビルドゲーム、アルティマビルド。 トッププレイヤーの主人公は、ゲーム同様の異世界に生きたロボットとして転生する。 機械によって埋め尽くされた世界で、機械生体《リビルド》が生態系を形作っている。 人類はその中でも街を作り、技術と勇気で野生の凶暴なリビルドに立ち向かってきた。 だが街の守護神たるドラゴンリビルドが行方不明に。 調査のため奥地に旅立った龍巫女のアオイは龍の卵を見つける。 それこそは主人公が転生した姿だった。 アオイが巨大な機械に襲われたとき、主人公は龍の卵からロボットとして誕生、恐るべき力で機械を倒して彼女たちを守る。 ＜以下、ネタバレ＞ おりしも我を失ったドラゴンが街を襲撃。 龍巫女のアオイと龍の子たる主人公は街とドラゴンを守るべく力を合わせるが、ドラゴンは謎の黒巫女に連れ去られてしまう。 この事件を皮切りに、凶暴なリビルドの群れが人々を襲い始める。 対抗するべく主人公たちは新型ロボを開発、評価会に勝ち抜いて街の正式規格に採用される。 量産された新型ロボ部隊による探査の結果、闇落ちしたドラゴンがリビルドの大群を率いて街に攻めてくることがわかる。 かつては街の守り神であったドラゴンとの戦いを主人公は決意、対ドラゴン用のロボットとして己を改造する。 主人公は龍巫女と共に出撃、押し寄せるリビルドの大群を撃破し、遂にドラゴンと対決。 ドラゴンは黒巫女に洗脳されていた。黒巫女の目的は主人公とドラゴンを戦わせてより強くしていき、今度こそ世界を破壊させる最強の最終兵器に育て上げること。 主人公こそはかつて最強最終兵器を開発して世界を破壊しかけた存在だったが転生によりその記憶を失っていたのだ。 苦悩する主人公はしかし龍巫女と共に過去を乗り越え、ドラゴンを再生させて洗脳から解き放ち、最強の力をもって未来を創造する者となるのだった。