Dans un monde où la science a matérialisé toutes les composantes de l’âme, une société emploiera l’un de ces minéraux afin de produire des êtres synthétiques. Tomodachi est né produit de l’un de ces experiments dont l’objectif est de créer une espèce supérieure mais maîtrisable. Pourtant, il mènera sa propre recherche pour trouver ce qui le rendra humain. Parviendra-t-il à stopper les plans de Heal et accomplir son plus grand rêve?