星海暦875年。 人類が複数の恒星系に生存圏を広げた時代。 宇宙の学園ローバス・イオタに通う少年——ヤマセ・コウイチは、鬱屈した日々にうんざりしていた。 世話焼きな幼馴染の少女。 優秀な幼馴染の少年。 絡んでくる不良生徒達。 そんなある日の夜、コウイチは不思議な少女と——幽霊と、出会った。 『——消えて、ほしい？』 「……え？」 少女の呟きと共に突如、ローバス・イオタは異音と振動に包まれる。 日常が音を立てて崩れ始め、コウイチは極限の非日常へ巻き込まれていく——！ ——宇宙漂流×学園戦記、開幕！