人類の異能発現による第二次世界大戦の終結から約70年。人口が激減し、半分以上の大地失った世界が徐々に回復し始め、安定期を迎えた201６年。日本地区に住む少年・近衛貴樹（このえたかき）とその前に現れた謎の少女・龍見有栖（たつみありす）二人が出会った日そのから貴樹の日常が静かに崩れていく。