第三次世界大戦後の世界。 巨大隕石の落下により混乱に陥った人類は、新たな国家の枠組みで争いながらも再生への道を模索しようとしていた。 しかし隕石からは人類に敵対的な生命体CEMが現れ、人類は星の支配者の地位を揺るがされる。 世界の激動の中で勢力が三つに分かれた日本人は互いに血を流して争い、各々が思想と思惑の元に日本の再統一を目指していた。 これは旧日本領九州に建設されたコロニー『大和』から始まる――大切なものを奪われた弱者たちの誓いと後悔と覚悟の物語で――人間と魔女の物語だ。