高天原学園。 新旧二つの校舎に山まであるこの高校には、七不思議を集めると神様に願い事を聞いてもらえるという話が存在する。 転校生・黒木暁はテンコと名乗る美少女に科学部へと誘われて入部するが、奇妙な行動をする部長に翻弄される事となってしまう。 そんな科学部は、名ばかりで部活動自体は何一つせずお茶を準備する美人の先輩猫田。 書き物や本を読んでいるだけの見掛け小学生の美少女、鬼頭。 窓の外を見ているだけの二年生の竜見。 体は大きいがお菓子を準備するだけの深海。 なぜか女子トイレでメールで会話する美少女の水野と、個性的な面々が居るだけであった。 部長の提案で七不思議を集める事となった暁は、クラスメイトの木戸に手助けされて様々な七不思議を集めて回る。 そして、七不思議巡りを始める。 そこで暁が知ったのは、意外な真実であった。