ある時、世界中の塔がダンジョン化した。東京タワーも例に漏れず迷宮（ダンジョン）化し、変貌の時そこに居た者たちは巻き込まれ、消息を絶った。会社員の許斐士郎も塔の迷宮化で家族を失っていた。そんな彼の元へ、一人の女子高生が尋ねてくる。彼女もまた家族を失っていたのだ。曰く家族を捜索するため、一緒に迷宮へと潜って欲しいというのだった！かくして、士郎は迷宮へ挑むことを決意するのだった。