―時は、スクラップから生まれた120cmのロボット『ジャンクロン』と共存する社会…。人間と生活し、共に悪と戦う、元『人間』だったロボットである。
”発達障害”を持っている中学生3年生の少年『大空 大地（おおぞら だいち）』は、女性型ジャンクロン『イブキ』と一緒に生活をし、来年に控えている受験勉強と、数起きる事件を解決していく。
そして、ジャンクロンが生まれたきっかけ、【鉄くず様の神隠し】の問題へと、直面していくのであった…。