ある所に一人の少年が居た。その少年は魔法という特別な力を使うことができる稀人だった。だが、とある理由で深い致命傷を負っていた。 ある一人の女性はその少年に自分の血を分け与えた。すると、たちまち少年の傷は塞がり、その命が途絶えることはなかった。女性はその少年を大事そうに抱き抱え、自らの住処に連れて行くことにした。 次に、少年が目を覚ますと女性から事情を聞き、自分の命が救われたことを自覚する。女性は少年に助けた代償を伝える。 それは魔女である女性の弟子として、魔法の世界でこれからの人生を過ごす事。 その時、少年の第二の人生が幕を開けた。 魔女の血という才を得た少年は魔法学園でその才を振るい、多くの出会いと成長を遂げる。 黄昏の魔女の弟子となった少年に下されるその大きな運命とは一体。 学園魔法ファンタジー開幕。