メドゥーサという人を石化させる化け物や、魔法のような特別な能力を持つ人間が存在するこの時代。 最強な能力とされる能力を持つ少女、藤白莉瀬(ふじしろりせ)は今まで人目に付かずひっそりと生きてきたもののひょんなことからメドゥーサ狩りや能力悪用者を取り締まる組織、八咫烏(やたがらす)にスカウトをされた。なんと女性隊員初の“S級隊員“として。 そんな出来事により各方面から注目を浴びた彼女は、仲間と共にメドゥーサを狩りながら、とある秘密を知り‥‥？