海外で傭兵として活動していた男、羽黒修平＜はぐろしゅうへい＞は、ダンジョンが生まれる余波に巻き込まれ、ダンジョンの中で活動停止状態となる。 次に目を覚ました時には———100年間の時間が経過していた。 ダンジョンや＜異能＞と呼ばれる特殊な能力があるのが当たり前となった社会で、鍛え上げた技術と知識、「羽黒流」の忍術を用いて、修平は100年後の世界を駆け抜ける。