西暦２２４５年、ＡＩが人類を襲うという事件、通称『シンギュラリティ』から１６８年。ＡＩは違法とされ、人々は義体と呼ばれる機械の体へと進化を遂げた。そんな中、公安特務部隊「埋葬課」に所属する剣崎零《けんざきぜろ》は、違法ＡＩを狩る「処刑人」として暗躍していた。 ある日、剣崎は違法ＡＩの噂を追って、機械城塞都市・鋼鉄劇場に潜入する。そこは、全身義体化した男『機械伯爵』が支配する、欲望渦巻く闇の世界。しかし、伯爵はただの違法ＡＩ利用者ではなかった。彼の電脳は既に違法ＡＩの悪性プログラムに汚染され、常軌を逸していたのだ。 圧倒的な力で剣崎を襲う伯爵。しかし、剣崎は生身でありながら、特殊な武術「破械流」を駆使し、応戦する。 激しい戦いの末、剣崎は伯爵を追い詰めるが、予想外の事態が起こる。 古代遺跡より目覚めた謎のＡＩ搭載ガイノイド「アイ」との出会い。それが剣崎の運命を大きく変えることとなる。彼女は、剣崎の知るＡＩとはまるで異なり、人間と同じような心を持っていた。 純粋な心を持つＡＩ「アイ」の存在が、物語を大きく動かしていく。ＡＩとは人類の敵なのか、それとも…？