魔法と剣の世界、『ガルパ大陸』は、巨大人型兵器を操る『謎の軍勢』により西方が侵略される。 そして、東方の宗教国家、バルム聖国にも敵が迫っていた。 国境沿いにある聖神教寺院の町、スータムにも巨大人型兵器が現れ、今まさに攻撃されようとしているところだった。 スータム寺院の聖女、ナタリアはこの町の守り神として祀られていたゴーレムに祈りを捧げる。 「軍神様、お目覚めください。そして、この地をお守りください」 その声に導かれ召喚されたのは、宇宙移民解放のため地球軍と戦っていた学徒兵、タケト・カミカワだった。 目覚めたばかりの『巨神グーム』を操り、タケトは襲ってくる巨大人型兵器『アーマードフレーム』十機に立ち向かう―― 魔法と剣の異世界ファンタジー VS スーパーロボの大戦記、ここに始まる――