幼いころに両親を亡くした広瀬玲衣は、考古学者である叔父の広瀬渉に引き取られる。 そこで叔父の手伝いをしながら学問に励んでいた玲衣は、親友の浦野天空に教えてもらった廃村の調査に一人で向かう。 そこの村には男しか産まれないという言い伝えがあり、我意阿様という者を祭って、毎年生贄を捧げる儀式を行っていたという資料を発見する。 特に資料以外のめぼしいものが見つからなかったため帰ろうとしたとき、秘密の地下階段を発見する。 その先には死んでいると思われる男性が倒れていた。 驚いて呆然としていたところを背後から女性に襲われ、謎の液体を飲まされる。 再び目を覚ました玲衣は自身が女の子になっていることを知って、元に戻る方法を探すために我意阿様の秘密を追う。