前作の主人公であった剣桃太郎（つるぎ・ももたろう）の息子と新たなる塾生達が活躍する「魁!!男塾」の続編。渋谷センター街を行進していた男塾塾生達は、彼らを馬鹿にした茶髪の若者らに制裁を加えていくが、そこへ現れた青い目をした青年に全員がぶちのめされてしまう。同じ頃、男塾塾長の江田島平八（えだじま・へいはち）に会いにきた剣桃太郎は、自分の一人息子・獅子丸（ししまる）を男塾で預かってほしいと言って……!?