魔女〈アイリスウィッチ〉の少女アセビは、失踪した母を探す旅の途中、不時着した浮遊島で謎の少女ピエリスと出会う。 自身を、二十年前の月破壊を引き起こした大量破壊兵器の制御ユニットだと語るピエリス。 ふたりの出会いは、二十年前の大災禍の真実を暴き出す。そして同時に、新たな災厄の引き金となる。 これは、ふたりの出会い、戦い、別れを辿る、ひと夏の物語。