โลกที่กำลังวุ่นวายเพราะดันเจี้ยนที่ปรากฏขึ้นมา เหล่าผู้คนที่เคยมีความหวังเพราะฮันเตอร์ที่เก่งที่สุดอย่าง 'เซโร่' ได้ช่วยเคลียร์ดันเจี้ยนเหล่านั้นให้หายไป ก่อนที่ทุกอย่างจะกลับมาวุ่นวายอีกครั้ง เมื่อฮันเตอร์แรงก์ S ผู้นั้นได้หลายตัวไปถึง 10 ปี ก่อนที่ฮันเตอร์แรงก์ S รุ่นใหม่อย่าง 'เรย์' จะพบกับความผิดปกติ เมื่อพนักงานทำความสะอาดที่เขาเจอ มีหลายสิ่งหลายอย่างที่ทำให้เขานั้นอยากที่จะค้นหาความจริง และอีกฝ่ายก็อาจจะเป็นคนที่เขากำลังตามหาอยู่