涼は昔から他の人に見えないものが見えてしまう その事で家庭が壊れた経験から、見えることは隠し、周りに合わせてなあなあで過ごしてきた しかし、ある夜怪異に巻き込まれてしまい、一人の美少女、小夜子と出会い、怪異による事件に巻き込まれてしまう そして発生する不可解な学校の生徒の死 それを解決するのに小夜子に協力を求められる 小夜子の所属する天文部に強制的に入部させられ、小夜子と共に恐ろしい事件を起こした犯人を探す 怪異を操る者たちの戦いに巻き込まれ、自らも戦うことを余儀なくされた涼 怪異を憎む小夜子との関係が徐々に深まるにつれ、涼は日常を手放さなくてはいけなくなっていく 悪意を持って怪異を操り、人々の平穏な日々を奪うものから学校を守れるのか