平成45年。世界は正体不明の巨大生命体「タナトス」の襲撃によって苦しめられていた。
それに立ち向かうために建造されたのが「ネメシス」である。全世界に広められたネメシスを駆使して各国の軍隊は激戦を強いられている。
望月將悟は「タナトス」の襲撃で家族を失い、養父までも失ってしまう。
そんな彼はネメシスのパイロットとなり、仲間たちと共にタナトスから帝都を守っている。
うら若き彼らの手にするものは幸福かそれとも…