サイバネティック技術が発達し、企業連合が裏から国家を支配している日本。 そこでは超人的なニンジャとサムライが暗躍していた。我こそはこの国を支配するものだと戦いを繰り返し、世はまさに世紀末。 そんな中、普通に生活していた女子高生のヨモギ・クロハはある日突然ニンジャとサムライの抗争に巻き込まれ、命からがら生き延びる。 その時に出会った一本の刀を手に取り、復讐を誓う。 日常を壊したニンジャもサムライも、この手で殺すと。