Born to War ―― 約３００年前、突如飛来した２種類の異星生命体の争いに巻き込まれ、滅亡の危機に瀕した人類。 奇跡的に生き残った人類は人類初の統合政府を作るとともに、暦を西暦から復興歴と改め、人類存続の道を探求し始めた。 人々は地下の大都市に移住し、火星に移住し、木星を採掘場とし、人間そのものも改造した。 機族という人工知性体を生み出し、重力を制御し、外宇宙への人類播種計画までも実行し始めた。 そんな時代に生まれた４人の若者たち。 遺伝子交雑者（ハイブリッド）としては失敗作の式守直也。 遺伝子調整者（デザイン）のエリートとして育てられたクリスティーナ・〈ネルソン〉・ハンブリング。 同じ遺伝子調整者（デザイン）であり、ライバルでもあるフランチェスカ・〈東郷〉・トモエ。 ごく普通の健常者（ノーマル）な訓練兵、天羽智花。 生まれも育ちも違う４人は、やがて１つの部隊で出会う。 折しも、宇宙から来た化け物――ＩＮＶＥＬＬが１２年ぶりに太陽系に侵入。 再び訪れた人類存亡の危機に、彼らとその同期たちは地球防衛のために木星宙域へと出撃する。