私立八百万学園に通う「和徒村　英一（わとむら　えいいち）」。 通称『ワトソン』。 彼はどこかの部活に所属しなければいけないという校則で、 仕方なしに部員割れによって廃部寸前だった新聞部に入ることになった。 そんな彼の所属する新聞部に伝統として伝わっている部訓がある。 「百の特ダネより、一つの謎解き」 学園新聞を発行することよりも大事なことは、謎を解くことだという初代部長の信念である。 そんな新聞部としてあるまじき信念を持つ初代会長、ホームズの愛称で呼ばれる「片難　六駆（かたなだ　ろっく）」と、 副会長のミス・マーブルこと、新聞部紅一点の「馬淵　純（まぶち　じゅん）」。 そんな３人が学園で起こった事件に挑む学園ミステリー。 伝統といってもまだ誰にも受け継がれていない部訓に疑問を持ちながら、 先輩二人の迷推理に常日頃から振り回されているワトソン君。 そんなある日、片難は学園七不思議の一つである「見知らぬ女生徒」を見た生徒がいるという噂を聞きつけた。 招集される新聞部一同（３名）は、その噂の真相を調べるべく乗り出したのだったが……。