2040年、機械兵器による侵略を企む組織メシア
機械兵器を迎え撃つ組織クルセイダーによる戦闘が激化している中、クルセイダーに新しく追加された戦力、ライダーたちによる機械兵器殲滅による大打撃を受けたメシア、だがメシアも打開策を持っていたのであった