新暦0081年、空戦魔導師・高町なのは25歳。不屈の魂—エース・オブ・エース—は、いまだ、健在！特務六課見習いとなったトーマとリリィ、アイシスの前に現れる新たなエクリプス感染者とは——!?第二部、本格始動！