地球上の全ての植物が異常成長して都市を侵食する現象「カウンターグリーニング」発生から三十年後。 激変した地上環境により、人類はその個体数を大きく減らすことになったが、それでも生き延びている人々はいた。 樹海の迷宮と化し、貴重な資源と凶暴な敵性生物を内包する東京２３区。 今は「東京深樹区」と呼ばれるようになったこの街で、一人の少女が資源回収のため、今日も戦う。 生きていかなければならない。この世界で。