北国で渓流釣りを嗜む少年、流渓太。高校卒業まで残り半年となったのにも関わらず、未だに進路が決まってない。
　日課の釣りを終え、家に戻ると見知らぬ男が……その男の名は、相沢魚影！彼はパンフレットを手渡す。『フィッシングアカデミア』……！なんと、釣り専門学校のものだ！
　
　これは様々な魚種が生息する島で、互いの知識と技術を駆使し、衝突し、高め合い釣り人（アングラー）として成長していく物語だ。