安倍晴明の血を引く土御門家の嫡男、土御門刃（ジン）には陰陽師の才能がない。現代の陰陽道では、銃やドローン、パワードスーツなど、多種多様な〝呪具〟を駆使して妖魔を調伏する。ところが、ジンが使える祭具は時代遅れの刀のみ。陰陽師の戦いが近代戦へ移行していくなかで、ジンの居場所はどこにもなかった。 東京の本家を追い出されたジンは、幼なじみの伊藤鏡子（キョーコ）に支えられ、京都で平凡な高校生活を送る。ところが、2019年の夏、京都各地に〝ダンジョン〟が出現した。神泉苑に、三十三間堂に、人形寺に、六道珍皇寺に。ダンジョンは現世と魔界をつなぐ〝門〟から力を吸収し、巨大な生き物のように成長していく。後に〝ダンジョン災害〟と呼ばれる悪夢の幕開けだった。 ジンとキョーコは不運にもダンジョン災害に巻きこまれる。羅生門――かつて平安京の南にあった都の表玄関は、合計2階層のダンジョンに変貌していた。ジンは屍鬼の群れを打ち倒すが、行く手に強力な徘徊モンスター（ワンダラー）が立ちふさがる。ジンは再び妖狐の千雪（ユキ）とタッグを組み、陰陽師として戦うことを決意した。 ダンジョンの出現は物語の序幕にすぎない。ダンジョン出現の数時間後、首相官邸のホームページがハッキングされ、〝阿修羅血社〟を名乗るテロ組織の声明文が掲載される。彼らは日本政府にこう宣言した――我らは積年の恨みを晴らし、この京都に〝魔都平安京〟を復活させると。 さらなる力を求めるジン。頼れる相棒のユキ。〝破邪の瞳〟を開眼したキョーコ。そして、3年前に亡くなった地上最強の姉――土御門焔（ホムラ）。京都の治安を密かに守る〝六波羅探題〟や、反魂の術によって甦った〝死冥衆〟の介入もあって、人類と妖魔の戦いは混迷を極めていく。 平安京ダンジョンを攻略するのは誰か？ 無数の刃（ヤイバ）を操る陰陽師が〝最強〟を目指すダンジョン伝奇アクション。