この世に異生物と呼ばれる正体不明のモンスターが現れて４年。人類は滅びの危機に…なることはなかった。 各地の軍隊で対処できる程度の異生物は、いつしかちょっとした自然災害として受け入れられてしまっていた。 そんな中日本にのみ現れるようになった５０メートル級異生物に対抗できるのは、こちらも正体不明の大型ロボット『ミスステール』のみだった。 各国はミスステールの秘密を探るべく国際連合軍を派遣。表では異生物に対処しつつ、裏では誰も知らない『ミ二ステール』の調査に勤しんでいた…… 「いや…もうあんな機械のカラダで戦うなんて懲り懲りよ！」 そんなミニステールの正体が、華の女子高生が変身したものだとは知らずに。