二十一世紀末期の日本。主人公、和泉海斗は、鬱系のぐーたら高校生。彼はほか三人の仲間と共に、海洋底での地形観察・生態系分析に借り出される。しかし、彼らは半強制的に謎の海底構造物――海底ダンジョンへと迷い込む。同伴した大人たちは、このダンジョンを探検するのが目的だったというのだが、それは高校生たちが教えられていたプログラムとは似ても似つかないものだった。 海斗たちはダンジョンを攻略し、大人たちの野望を打ち砕くことができるのか？