高校生である美咲の元に、ある一通の手紙が届いた。それは数日前、突然と自分の元から姿を消した親友、彩から届いたものだった。

『桜並木をまっすぐ進むと、小さな看板があります。それを頼りに歩くと、「ニンゲン動物園」という場所に着きます。私はそこで鳥として暮らしています。』

不可解な封筒、謎の文章。ニンゲン動物園という不思議な言葉を手がかりに、美咲は彩を探しに行くことにする。