未来学園高等部の生徒である陸上部の青年、天野誠也（あまのせいや）は偶然出来た休日を利用して未来区の隠れ釣りスポットである未来湖へと向かっていた。 釣りを始めたのも束の間、天候が荒れ始めた矢先に雷が天野誠也に直撃して彼は意識を失う。 夏休みが終わる頃、奇跡的に目を覚ました天野誠也は違和感を覚えながらも再び元の日常へと戻り始める。 しかし、運命は彼を逃さない。落雷によって天野誠也は『電脳世界に介入する』能力に目覚め、未来区、ひいてはこの世界の真実に直面することとなるのだった。