警察庁地下５階にある『緊急時特別調査室』。そこには１２歳と１３歳の中学生が配属されていた。
彼らが担当する最初の事件は殺人。しかし現場は日曜日の学校。防犯カメラは前日に壊されていて映像記録はない。学校で起きた殺人事件をなるべく知られないようにしたい理事長に違和感を覚えた彼らは理事長について調べ始め、分かったものは…。