阿部真悟は繰り返し同じ夢を見ていた。 それは過去、自らが幼い頃の日常的な風景だった。 母親である真理に寝かしつけられている真悟、そのすぐそばで優しく子守唄を歌う真理。 決まって真悟が寝落ちしそうになると、必ず母親は同じセリフを言うのだが、いつも肝心な所が聞き取れず、記憶からすっぽりと抜け落ちてしまっているようだった。 そこが気になる真悟だが、真理は既に亡くなってしまっていて、確認を取る術はない。 答えを知りたい真悟は、一縷の望みにかけて、母親が生まれ育った町で叔母である茜の元へと居候をすることになる。 真理が育った生家で生活し、真理の通った高校に通い、真理の作った謎部活、真理部へと入部する事になる。 一学年上の雨宮推理、橋渡綾、クラスメイトの葵木涼太、顧問の屋敷と謎解き？をしながら高校生活を送る事になる。