矢名瀬美乃は高校一年生。 難関の進学校・梁山高校に入学した美乃は、家計に負担をかけぬため勉強以外の要素を全て排除するつもりだった。 だが意に反して、クラス委員に選ばれてしまう美乃。 しかも相方は「フヌケ」と揶揄される、うだつの上がらない少年――滝宮凪だった。 渋々凪と共に生徒会会合に出席した美乃は、そこで副会長・柳下朋彦の傷害事件に遭遇する。 目安箱に手を入れた柳下が、針に覆われた異物で怪我をするというものだった。 一体誰が、いつ、どのようにして異物を箱に入れたのか。 混迷する謎に対し、持ち前の好奇心を抑えきれなくなった美乃は、凪と共に調査に乗り出す。 一癖も二癖もある執行部の面々から、話を聞き出す美乃。 だが肝心の異物を入れた方法がどうしても解けない。 行き詰まる少女に、あるアクシデントが起こる。 誰かが自分の机にカエルを入れたのだ。 美乃は凪から借りた「あるもの」で、どうにかカエルを外に出す事に成功する。 その瞬間、美乃は異物を入れた方法を思いつく。 そして、犯人の正体も…… 次の日、犯人と対峙した美乃と凪は、謎解きを始めるのだった。 事件が解決した後、美乃はカエルを入れたのが凪だと直感する。 それは、美乃にヒントを与えるために仕組んだものだった。 そしてこの時、凪が実は凄まじい洞察力の持ち主であると気付く。 凪と関わる中で、美乃の意識や高校生活は次第に変化していくのだった。 四六時中フヌケている凪と、短気な才女・美乃―― 校内で起こる様々な怪事件に、凹凸コンビの挑戦が始まる！