横浜の高校生・はるひは港で倒れていた外国人の少年を助ける。記憶を失った彼の手がかりは「３３」。しかし彼は不思議な能力を持っていた。超自然パワーで人々を治癒し「聖者（セイント）」と呼ばれるようになる。