소년의 몸에 깃든 정의의 유전자. 운명의 아이는 진정한 영웅으로 거듭날 수 있을까. 초대 울트라맨이었던 하야타 신의 아들 하야타 신지로. 그는 부친의 몸에 남아 있던 울트라맨 인자의 영향으로 태어나면서부터 특수한 능력을 가지고 있었다. 평화롭다 생각되던 하야타 부자의 생활은 갑자기 들이닥친 적의 공격에 의해 일변하고, 신지로는 거부할 수 없는 운명에 휘말려 가는데…….