粗暴な行いによって姉・アマテラスの怒りを買ったスサノオ。神としての力を封じられ天界から地上に落とされたところを、ナギという名の少年に助けられる。ナギはクシナダ村という大きな村で、雇われ人夫として働いていた。力を封じられ無力なスサノオだが、傲慢さは変わらない。最初は呆れていたナギだったが、だんだんスサノオに惹かれ仲良くなっていく。じつはナギは、ある事情から男のフリをして生きてきた少女だった。一方、平和な村に見えたクシナダ村は、「ヤマタノオロチ」という化け物におびやかされており――…。