검은 조직에 의해 어린아이가 되어버린 고등학생 명탐정 신이치! 그는 자신과 주변 사람들의 안전을 위해 「코난」이란 이름으로 여자 친구 란의 집이자 모리탐정의 사무실에서 함께 살게 된다. 자신을 어린아이로 만들어 버린 검은 조직의 실체를 파헤치며 추리라곤 전혀 못하는 모리탐정 대신 어려운 사건을 척척 해결하는 「코난」의 명추리는 오늘도 계속된다!!