北政府と南大陸自由圏との紛争が続く世界――。尖端諸島・南涯島に暮らす少年・高灯イッシンは、テシク族の姉妹・カラヒナとヒナと共に、ルイコンの聖地・胎動窟を目指して旅立つ。しかし双子の妹＝ヒナには、異形の神“ザムド”の能力が秘められていた……。TVアニメ『亡念のザムド』を舞台に、少年と少女達の新たな冒険が幕を開ける、コミック版オリジナルストーリー!!