名だたる武将のDNAを持つ者が集い、覇権を争う武士道学園。ごく普通の少年だった武田哲郎（たけだ・てつろう）はある日、自らが武田信玄（しんげん）のDNA保有者だと知らされ、学園で天下を目指すことを強いられる。早速、学園内で北条氏康（ほうじょう・うじやす）DNA保有者・北条綾（あや）に命を狙われる哲郎の前に一人の刀を手にした美少女が出現。彼女こそ武田信玄の忠臣・真田昌幸（さなだ・まさゆき）のDNA保有者である真田理絵子（りえこ）だった……。戦国学園絵巻、ここに堂々の開幕！