まりあの姉に待望の赤ちゃん・正紀が誕生。だが、その日から、まりあの身には不思議なことが起こる。なんと正紀は“不思議な力”を持って生まれたハイパーベイビーだったのだ！　正紀の「意識」は、体が眠っている間に少年の姿になって現れ、まりあと香月に、2人でぼくを守ってくれと頼み、3人の過去の関係を視せる。そして現代。正体不明の敵が正紀に忍び寄る。お互いの関係にとまどいながら、3人は事件の渦中へと…！　世紀末ミラクル！