コウタは物理学を専攻する学生で、友人たちと静かに暮らしたいと願っていた。しかしある日、彼らはいくつかの地域、特に千島列島で発生した異常事態に衝撃を受ける。千島列島は、ワープ航法宇宙船プロジェクト「プロジェクト747」の開発において、ロシアとアメリカが共同で実験を行う場所として指定されていた。しかし、このプロジェクトは、偶然にも惑星間ポータルを作り出してしまったことで大惨事となり、キサントンと呼ばれる生物と対峙せざるを得なくなる。キサントンは並外れた知能と高度な文明を持つ生物だが、その裏では絶滅の危機に瀕しており、DNAや臓器がほぼ同一であることから、最終的には人類を繁殖手段として狩り立てるようになる。こうして、コウタ、アカネ、そして友人たちは、惑星間のゲートを遮断するために抵抗組織に加わり、人類を救うことができるのだろうか？