21XX年。海中に落下した隕石から出てきた光るカプセル。そこには、年格好が十三、四歳の西洋人みたいな女の子が入っていた。 彼女は「小鳥」と名付けられ、新宇宙科学研究所で退屈な検査を繰り返す毎日だったが、ある日、登校する男子高校生の「大気」に一目惚れしてしまう。 敷地から外に出られない小鳥は、VR装置を使って大気と塀の外に出てバーチャルなデートを楽しむ。しかし、彼は忽然と消えてしまった。 その原因が判明した小鳥は、大気の正体を知ることになる――。