江戸の町を襲った災害から二日後、黒有理たちに吹き飛ばされた猫又は清太に拾われてそこで傷を癒していた。そこへ猫又を探し出した黒有理が乗り込み、再び戦闘となる、だが今度は黒有理を襲うのは屈強な甲賀忍びだ。 今度は馬喰町を舞台に忍者と黒有理の死闘が展開される。