赤道上空50,000mにそびえ立つ「バベルの塔」最上階の実験施設。突如発生したガードメカの暴走事故を鎮圧したのも束の間、女生徒が空間に巨大な亀裂に飲み込まれ、主人公は必死に手を伸ばすが、わずか数センチのところで指先はすれ違い、二人は無音の「時空の深淵」へと引きずり込まれていく。